翻译 - TCGAbiolinks 4 - Clinical data

TCGAbiolinks:临床数据发表时间:2019年3月20日TCGAbiolinks提供了一些搜索,下载和解析临床数据的函数。本节首先解释GDC中临床信息的不同来源,然后提供访问不同来源临床数据的必要函数,最后显示不同来源临床数据之间的不一致。1. 一些有用的信息1.1. 临床数据:不同来源在G

翻译 - TCGAbiolinks 3 - Downloading and preparing files for analysis

TCGAbiolinks:数据下载和准备发表时间:2019年3月20日TCGAbiolinks提供了一些从GDC进行数据下载和数据准备的函数,以方便进行下游的分析。1. 信息介绍本节首先解释不同的下载方法和SummarizedExperiment对象,它是TCGAbiolinks中使用的默认数据结构

翻译 - TCGAbiolinks 2 - Searching GDC database

TCGAbiolinks:搜索GDC数据库发表时间:2019年3月20日TCGAbiolinks提供了一些搜索GDC数据库的功能。本节首先介绍GDC数据的两个可以用的源:Harmonized和Legacy Archive。然后提供一些实例,探究如何如何访问和使用它们。1. 一些有用的信息1.1. 不

翻译 - TCGAbiolinks 1 - Introduction

介绍发表时间:2019年3月20日TCGAbiolinks通过GDC Application Programming Interface (API)接口访问 National Cancer Institute (NCI) Genomic Data Commons (GDC)数据库,从而可以搜索、下载

TCGAbiolinks-TCGA分析

开始接触TCGA数据,想学习如何下载、处理、分析这些数据。在目前的常用分析包中选中了R包TCGAbiolinks。下面就记录我的学习过程,实际上本身TCGAbiolinks的官方教程就比较完整,我就按照官方教程学习如何处理,并将其翻译为中文,和大家一起学习。官方教程翻译:翻译1 - TCGAbiol

蛋白-配体互作分析(2D & 3D)

在完成蛋白和分子的对接后,我们会得到蛋白和分子的亲和力得分值,当然不同的软件,如Sybyl、GOLD、AutodockVina等,这些软件的得分取值范围存在存在很大的差异,这里我们就不进行详细的讨论了。在这里我想和大家分享的是关于对接的后续分析。我们经常的论文中看到下面两种类型的图,他们分别表示蛋白
Your browser is out of date!

Update your browser to view this website correctly. Update my browser now

×