AlphaJP's Blog
首页
归档
分类
全部
生物信息
药物辅助设计
代谢组学
科研绘图
网络工具
开源系统
9999-05-30 Sun
(2)
(567)
资源汇总
在这里收集一些常用的资源:1. 趣站不死鸟软件资源、代理,网络资源的集合地2. 学术scmor提供Google、Google Scholar的镜像列表,每个大概8个镜像谷歌镜像导航谷歌学术镜像网站80 学术数据支持:谷歌学术,Sci-Hub,LibGenDogeDoge搜索搜索引擎,搜索结果精准萌搜
阅读更多
2019-10-14 Mon
科研绘图
(0)
(1,948)
Cytoscape - 介绍及网络构建
1.前言大家在阅读SCI文献时候经常能看到很多精美的网络图(Network)(图1),我们可以看到网络图中的节点(Node)具有不同的颜色,不同的大小,而边(Edge)也具有不同的粗细,那么这些网络图蕴含着什么信息呢?简单的说,研究者们喜欢通过Network来直观的展示其研究结果。在这些Networ
Cytoscape
阅读更多
2019-06-11 Tue
药物辅助设计
(0)
(1,461)
Amber系列1 - Amber16介绍和安装
1. Amber - 介绍Amber是一套让用户能够进行分子动力学模拟的程序组, 特别是用于生物分子的模拟. 没有单个的程序使用Amber这个名称, 但各部分能很好地协同工作, 并为许多常用的计算提供了强大的框架. [1, 2] 术语Amber也用来指实现的经验力场. [3, 4]然而, 应当认识到
Amber
阅读更多
2019-06-11 Tue
药物辅助设计
(0)
(716)
Autodock系列3 - 蛋白晶体的选择
其实我们在对接的过程中,无论你用的是什么软件(开源免费的Autodock,还是商业的SYBYL等),我们都需要选择靶点对应的蛋白晶体结构文件作为受体。有时候大家不知道如何去选择蛋白晶体?选择好蛋白晶体后如何处理?这里,我将和大家分享一下,我的处理过程。如果您有其他的处理流程,请在下面的评论处下,分享
Autodock
阅读更多
2019-06-11 Tue
药物辅助设计
(0)
(988)
Autodock系列2 - Windows系统下的对接步骤
说明:本教程主要使用了AutoDockTools-1.5.6, AutoDock Vina、PaDEL-ADV等软件1. 必备软件的安装分别安装下列软件的Windows版本:1. MGLTools http://mgltools.scripps.edu/downloads说明:这个软件中包含了Aut
Autodock
阅读更多
2019-06-11 Tue
药物辅助设计
(0)
(2,590)
Autodock系列1 - 分子对接简介及操作
说明:本教程主要的内容来自Yunwen Tao、Xianlong Wang、Yunfeng Jiang、Bin He等人所做的教程,感谢这些作者的贡献1. 分子对接的生物学背景分子对接的最初思想起源于 Fisher.E 提出的酶与底物相互作用的“锁和钥匙模型",它指的是底物和酶(也就是分子
Autodock
阅读更多
上一页
下一页
1
2
3
4
5
最新文章
9999-05-30 Sun
资源汇总
2019-10-14 Mon
Cytoscape - 介绍及网络构建
2019-06-11 Tue
Amber系列1 - Amber16介绍和安装
2019-06-11 Tue
Autodock系列3 - 蛋白晶体的选择
2019-06-11 Tue
Autodock系列2 - Windows系统下的对接步骤
最新评论
2020-04-11
SS :
请问最后这个cyt文件导出后怎么使用呢,在cytoscape里面
2020-04-02
学术镜像 :
学术镜像失效了,博主可以看看这个 思谷学术 https://siguso.com/google/ 也运行几年了
AlphaJP
文章
31
分类
6
标签
14
分类
生物信息
17
药物辅助设计
5
代谢组学
5
科研绘图
3
网络工具
1
开源系统
0
标签
TCGA
10
TCGAbiolinks
10
WGCNA
7
peakPantheR
4
Autodock
3
PyMOL
2
下载工具
1
Cytoscape
1
XCMS
1
LigPlot+1
1
PoseView
1
PLIP
1
Amber
1
博客系统
0
标签云
WGCNA
TCGAbiolinks
TCGA
Amber
PLIP
PoseView
LigPlot+1
XCMS
peakPantheR
Cytoscape
PyMOL
Autodock
博客系统
下载工具
最新文章
9999-05-30 Sun
资源汇总
2019-10-14 Mon
Cytoscape - 介绍及网络构建
2019-06-11 Tue
Amber系列1 - Amber16介绍和安装
2019-06-11 Tue
Autodock系列3 - 蛋白晶体的选择
2019-06-11 Tue
Autodock系列2 - Windows系统下的对接步骤
Your browser is out of date!
Update your browser to view this website correctly.
Update my browser now
×
分类
生物信息
代谢组学
科研绘图
药物辅助设计
开源系统
网络工具
标签
WGCNA
TCGAbiolinks
TCGA
Amber
PLIP
PoseView
LigPlot+1
XCMS
peakPantheR
Cytoscape
PyMOL
Autodock
博客系统
下载工具