生物信息 

翻译 - TCGAbiolinks 2 - Searching GDC database

TCGAbiolinks：搜索GDC数据库发表时间：2019年3月20日TCGAbiolinks提供了一些搜索GDC数据库的功能。本节首先介绍GDC数据的两个可以用的源：Harmonized和LegacyArchive。然后提供一些实例，探究如何如何访问和使用它们。1.一些有用的信息1.1.不同GD
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生物信息 

翻译 - TCGAbiolinks 1 - Introduction

介绍发表时间：2019年3月20日TCGAbiolinks通过GDCApplicationProgrammingInterface(API)接口访问NationalCancerInstitute(NCI)GenomicDataCommons(GDC)数据库，从而可以搜索、下载和处理TCGA项目中的数
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生物信息 

TCGAbiolinks-TCGA分析

开始接触TCGA数据，想学习如何下载、处理、分析这些数据。在目前的常用分析包中选中了R包TCGAbiolinks。下面就记录我的学习过程，实际上本身TCGAbiolinks的官方教程就比较完整，我就按照官方教程学习如何处理，并将其翻译为中文，和大家一起学习。官方教程翻译：翻译1-TCGAbiolin
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药物辅助设计  科研绘图 

蛋白-配体互作分析（2D & 3D）

在完成蛋白和分子的对接后，我们会得到蛋白和分子的亲和力得分值，当然不同的软件，如Sybyl、GOLD、AutodockVina等，这些软件的得分取值范围存在存在很大的差异，这里我们就不进行详细的讨论了。在这里我想和大家分享的是关于对接的后续分析。我们经常的论文中看到下面两种类型的图，他们分别表示蛋白
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科研绘图 

PyMOL - 开源版本安装

说明：实际上Windows和Linux差不多，当前教程参考这个版本的教程：https://pymolwiki.org/index.php/Windows_Install1.商业版本安装（IncentivePyMOL）直接到Schrödinger官网去下载（exe版本）就能安装。地址：https://
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实操 - peakPantheR
代谢组学 

实操 - peakPantheR

在翻译了peakPantheR后，我想按照它的教程在自己的电脑上走一遍，以便了解其中的命令细节。1.R包安装1.1.软件包安装设置镜像仓库，并将一些镜像的源替换成国内的，以便加速下载#设置镜像仓库setRepositories(ind=1:4)#int数值对应的镜像仓库#1:+CRAN#2:BioC
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代谢组学 

翻译 - LCMS data preprocessing and analysis with xcms

说明：最近在看一些代谢组学数据的处理，其中XCMS这个R包是非常好用的，但是目前对这个包还不熟悉。因此，到期官网查看相关文档，发现有几篇学习的文档。所以便翻译，边理解。也与大家共享。由于专业知识欠缺，有错误的地方请指正。实际上，大家最好看原文才能更好的理解这个包的用法。原文地址：http://bio
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代谢组学 

翻译 - peakPantheR-3: Parallel Annotation

ParallelAnnotationArnaudWolfer2018-06-13peakPantheR被设计用来对MS文件进行检测、积分和报告预定义的特征（detection,integrationandreportingofpre-definedfeatures）。对与上述的“检测、积分和报告预定
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代谢组学 

翻译 - peakPantheR-2: Real Time Annotation

RealTimeAnnotationArnaudWolfer2018-02-21peakPantheR被设计用来对MS文件进行检测、积分和报告预定义的特征（detection,integrationandreportingofpre-definedfeatures）。对与上述的“检测、积分和报告预定
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代谢组学 

翻译 - peakPantheR-1: Getting Started with the peakPantheR package

GettingStartedwiththepeakPantheRpackageArnaudWolfer2018-02-211.peakPantheR在R中用于高分辨率试验的峰选择（PeakPicking）和注释（ANnoTation）的包。通过R和Shiny实现2.Overview在MS文件中，pe
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