WGCNA - 共表达分析

1. WGCNA基本概念加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度协同变化的基因集, 并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或治疗靶

翻译 - TCGAbiolinks 9 - Extension

TCGAbiolinks - 新功能作者:Mohamed Mounir发表时间:2019年3月20日新功能:TCGAbiolinks版本TCGAbiolinks目前还提供了查询和下载TARGET数据库的数据的函数,并获得用于下游分析的SummarizedExperiments对象。此外,TCGAan

翻译 - TCGAbiolinks 8 - Case Studies

TCGAbiolinks:实例探究在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)1. 介绍在这里,我们展示了TCGAbiolinks的完整分析流程。分别在四个案例中展示相应的代码,这些案例是:Expressio

翻译 - TCGAbiolinks 7 - Analyzing and visualizing TCGA data

TCGAbiolinks:TCGA数据分析和可视化在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)1. TCGA的数据分析 - TCGAanalyze我们可以使用下面的函数轻松分析TCGA数据:1.1. 基因表达

翻译 - TCGAbiolinks 6 - Compilation of TCGA molecular subtypes

TCGAbiolinks:分子亚型在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)TCGAbiolinks从TCGA样本中检索分子亚型信息。函数PanCancerAtlas_subtypes和TCGAquery_

翻译 - TCGAbiolinks 5 - Mutation data

TCGAbiolinks:搜索,下载和可视化突变数据发表时间:2019年3月20日在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)1. 搜索和下载TCGAbiolinks提供了一些从GDC下载突变数据(mutat
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