翻译 - TCGAbiolinks 9 - Extension

TCGAbiolinks - 新功能作者:Mohamed Mounir发表时间:2019年3月20日新功能:TCGAbiolinks版本TCGAbiolinks目前还提供了查询和下载TARGET数据库的数据的函数,并获得用于下游分析的SummarizedExperiments对象。此外,TCGAan

翻译 - TCGAbiolinks 8 - Case Studies

TCGAbiolinks:实例探究在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)1. 介绍在这里,我们展示了TCGAbiolinks的完整分析流程。分别在四个案例中展示相应的代码,这些案例是:Expressio

翻译 - TCGAbiolinks 7 - Analyzing and visualizing TCGA data

TCGAbiolinks:TCGA数据分析和可视化在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)1. TCGA的数据分析 - TCGAanalyze我们可以使用下面的函数轻松分析TCGA数据:1.1. 基因表达

翻译 - TCGAbiolinks 6 - Compilation of TCGA molecular subtypes

TCGAbiolinks:分子亚型在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)TCGAbiolinks从TCGA样本中检索分子亚型信息。函数PanCancerAtlas_subtypes和TCGAquery_

翻译 - TCGAbiolinks 5 - Mutation data

TCGAbiolinks:搜索,下载和可视化突变数据发表时间:2019年3月20日在运行程序前,我们需要导入必要的包:library(TCGAbiolinks)library(SummarizedExperiment)1. 搜索和下载TCGAbiolinks提供了一些从GDC下载突变数据(mutat

翻译 - TCGAbiolinks 4 - Clinical data

TCGAbiolinks:临床数据发表时间:2019年3月20日TCGAbiolinks提供了一些搜索,下载和解析临床数据的函数。本节首先解释GDC中临床信息的不同来源,然后提供访问不同来源临床数据的必要函数,最后显示不同来源临床数据之间的不一致。1. 一些有用的信息1.1. 临床数据:不同来源在G
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